果树需要养分的平衡供给，有机肥中的养分虽然十分丰富，但氮磷钾的比例和含量还不能完全满足果树生长需求。尤其是在有机肥的堆沤腐熟过程中，氮的含量会进一步下降，如果单施有机肥要满足氮的需要量，磷、钾就会过量，造成浪费；如果磷钾正好满足了果树的需要，氮肥就不足。因此，单纯施用有机肥不能同时满足果树对氮磷钾的需求，应当与化肥配合施用。
      
       一、未经腐熟的有机肥对果树的危害
      
       1、灼伤根系农家肥大多来源于动物粪便。这些有机肥未腐熟时其养分状态是缓效性的，不能被果树根系直接吸收和利用，如果将其施入，在地下腐熟过程中，易产生热量造成根部灼伤（俗称“烧根”），引发根腐病。
      
       2、营养释放与树体需肥不同步。比如秋季施入未经腐熟的有机肥、由于土壤温度低，在地下腐熟需要较长时间。第2年春季，树体需要大量的营养物质，而缓慢腐熟的有机肥所释放出的有限的有机营养根本无法满足树体的需要。同时，在腐熟过程中微生物还会消耗掉一部分果树根系土壤中原有的营养元素（如氮肥），树体往往表现营养不良。进入夏秋季后，雨量增加，地温快速上升，腐熟速度明显加快，释放出更多的可被树体吸收的有机营养物质，导致树体生长加快，大量冒条，果实着色不良，营养生长过剩，花芽分化能力差，使大量的有机营养物质白白浪费，树体营养供给失调。有人曾经对施入生粪的果园掘土调查，发现3年后仍有部分生粪处在原来状态。
      
       3、极易招惹地下越冬的害虫。未经腐熟的有机肥由于含有大量的动物性有机质，故而成为许多果树害虫的理想越冬场所，特别容易招惹为害果树的金龟子（蛴螬）、桃小食心虫、尺蠖、舟形毛虫、梨花网蝽等，对虫害防治极为不利。
      
       二、有机肥的堆沤腐熟与施用
      
       在堆沤未腐熟的有机肥时，堆肥场地要选在背风、向阳、地势高的地方，在堆肥地面铺农膜或选水泥地面，要将农家肥中的畜粪结块打碎，秸秆要铡碎在5厘米以下进行碾压，并要混入约3％左右的过磷酸钙与粪土翻匀后进行堆积。加入过磷酸钙主要是防止有机肥中的氮素流失，并能增加微生物的活动。堆制好后把表面用铁锨拍平，用泥抹10厘米左右厚或用农膜覆盖，四周压严，制造缺氧环境，使之尽快腐熟。农家肥堆60天左右即可腐熟。当有机肥颜色由原来的灰色变成紫色、黑色，质地松散，有恶臭味时，说明已经腐熟，要及时施入果园。把充分腐熟的有机肥施入果园时，应选择树冠垂直投影下以外部位，开挖宽30～40厘米、深30～40厘米的施肥沟，将有机肥与适量化肥（氮、磷肥）和表土混均匀后投入施肥沟底，最后用翻出的底层生土覆盖，或进行全园撒施，撒施后翻入土层。